操作方法1：

先zcat再gzip

zcat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz | gzip - > test.fastq.gz

操作方法2：

直接cat

cat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz > test2.fastq.gz

压缩文件大小

ll test*.gz-rw-r–r– 1 An Lau 197121 1321311 6月 13 10:14 test.fastq.gz

-rw-r–r– 1 An Lau 197121 1321742 6月 13 10:15 test2.fastq.gz

解压缩文件大小

gzip -cd test.fastq.gz > test.fastq

gzip -cd test2.fastq.gz > test2.fastq

ll test *.fastq-rw-r–r– 1 An Lau 197121 7195186 6月 13 10:16 test.fastq

-rw-r–r– 1 An Lau 197121 7195186 6月 13 10:16 test2.fastq

对比文件内容

zcat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz | wc80000 100000 7195186

wc test*.fastq80000 100000 7195186 test.fastq

80000 100000 7195186 test2.fastq

160000 200000 14390372 total

虽然压缩文件大小不一样，应该是压缩率不同导致的，

但是不同方法出来的文件大小和内容都是一样的。

直接cat的速度肯定会比zcat … | gzip …快！

所有以后直接cat就可以了。

案例描述：需要将Sample_test1_R1.fastq.gz和Sample_test2_R2.fastq.gz合并为test.fastq.gz操作方法1：先zcat再gzipzcat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz | gzip - > test.fastq.gz操作方法2：直接catcat Sample_test_... 并在浏览器中打开index.html 文件 。 这个怎么运作 要生成质量控制报告， fast q.bio使用WebAssembly在浏览器中直接运行C工具 。 有关从C到WebAssembly的编译的详细信息，请参见项目。 fast q.bio使用库运行在WebWorker的WebAssembly模块和处理用户的 文件 安装到虚拟 文件 系统。 有关WebAssembly在某些情况下如何成为加速Web应用程序的强大工具的详细信息，请参阅《 。 超 快速 多线程 FAST Q多路分解 使用index1或index2将单个 FAST Q 文件 解复用为 多个 FAST Q 文件 。 该工具是用C ++开发的，支持多线程。 # read1 and read2 are precessed separately # -o specifies the output folder, and current working directory is used by default # -f specifies the filename suffix so that R1 / R2 can have different file name # -s specifies a samplesheet to defq how to demux defq -i in.R1.fq. gz -o demux_out_dir -s samplesheet.csv - c=($(cat fast q.list)) #当前目录下 fast q 文件 相对路径的列表 a=$1 # fast q 文件 所在的 文件 路径 mkdir pass #建立输出 文件 夹 b=`ls ${a}/*q |wc -l` ...