一、三种安装方式

（一）直接输入代码安装（推荐）

1、CRAN包

1、在 CRAN官网列表 找到包名。

2、安装单个包，输入如下命令：

install.packages('包名')
以ggplot2为例：
install.packages('ggplot2')
2、Bioconductor包
1、安装BiocManager。3.13为当时最新版本号，需要根据Bioconductor官网的发布更改。
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly=TRUE))
    install.packages('BiocManager')
BiocManager::install(version='3.13')
5、安装单个包，输入如下命令：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
    install.packages('BiocManager')
BiocManager::install('包名')
以Mfuzz为例：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
    install.packages('BiocManager')
BiocManager::install('Mfuzz')
7、如果安装多个包，输入如下命令，其他类比安装单个包：
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly = TRUE))
    install.packages('BiocManager')
BiocManager::install(c('包名1','包名2','包名3'))
（二）本地命令安装
1、下载包的压缩文件。Windows下载zip格式，Linux下载tar.gz格式。
2、输入以下命令。
install.packages('绝对路径')
如本地安装ggplot2：
install.packages('E:\R\package\ggplot2.zip')
（三）菜单栏中查找安装
1、菜单栏Tools-Install packages