singularity install conda

Singularity可以安装Conda环境,以便在Singularity容器中运行基于Anaconda的应用程序。下面是一种安装Conda环境的方法:

  • 使用Singularity创建一个新的容器,并在其中安装Conda:
  • $ sudo singularity create conda.img
    $ sudo singularity bootstrap conda.img https://raw.githubusercontent.com/singularityhub/singularityhub-recipes/master/recipes/conda/Singularity
    
  • 进入容器并安装所需的包:
  • $ singularity shell conda.img
    (conda)$ conda install numpy pandas matplotlib
    
  • 在容器中运行应用程序:
  • $ singularity run conda.img python my_script.py
    

    希望这些信息能帮助您。

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