Python如何读取数据量百万级的CSV文件数据?

Python新人一个 csv文件里有大概四百万行的数据,用Python做数据分析,读取数据的时候电脑风扇呼呼的,后来页面崩溃,恢复后看了一下大概读了四…
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13 个回答

大家好,我是 @无欢不散 ,一个资深的互联网玩家和Python技术爱好者,喜欢分享硬核技术。

欢迎访问我的专栏:

使用 open 函数去读取文件,似乎是所有 Python 工程师的共识。

今天明哥要给大家推荐一个比 open 更好用、更优雅的读取文件方法 -- 使用 fileinput

fileinput 是 Python 的内置模块,但我相信,不少人对它都是陌生的。今天我把 fileinput 的所有的用法、功能进行详细的讲解,并列举了一些非常实用的案例,对于理解和使用它可以说完全没有问题。

1. 从标准输入中读取

当你的 Python 脚本没有传入任何参数时,fileinput 默认会以 stdin 作为输入源

# demo.py
import fileinput
for line in fileinput.input():
    print(line) 

效果如下,不管你输入什么,程序会自动读取并再打印一次,像个复读机似的。

$ python demo.py 
hello
hello
python
python

2. 单独打开一个文件

单独打开一个文件,只需要在 files 中输入一个文件名即可

import fileinput
with fileinput.input(files=('a.txt',)) as file:
    for line in file:
        print(f'{fileinput.filename()} 第{fileinput.lineno()}行: {line}', end='') 

其中 a.txt 的内容如下

hello
world

执行后就会输出如下

$ python demo.py
a.txt 第1行: hello
a.txt 第2行: world

需要说明的一点是, fileinput.input() 默认使用 mode='r' 的模式读取文件,如果你的文件是二进制的,可以使用 mode='rb' 模式。fileinput 有且仅有这两种读取模式。

3. 批量打开多个文件

从上面的例子也可以看到,我在 fileinput.input 函数中传入了 files 参数,它接收一个包含多个文件名的列表或元组,传入一个就是读取一个文件,传入多件就是读取多个文件。

import fileinput
with fileinput.input(files=('a.txt', 'b.txt')) as file:
    for line in file:
        print(f'{fileinput.filename()} 第{fileinput.lineno()}行: {line}', end='') 

a.txt b.txt 的内容分别是

$ cat a.txt
hello
world
$ cat b.txt
hello
python

运行后输出结果如下,由于 a.txt b.txt 的内容被整合成一个文件对象 file ,因此 fileinput.lineno() 只有在读取一个文件时,才是原文件中真实的行号。

$ python demo.py
a.txt 第1行: hello
a.txt 第2行: world
b.txt 第3行: hello
b.txt 第4行: python

如果想要在读取多个文件的时候,也能读取原文件的真实行号,可以使用 fileinput.filelineno() 方法

import fileinput
with fileinput.input(files=('a.txt', 'b.txt')) as file:
    for line in file:
        print(f'{fileinput.filename()} 第{fileinput.filelineno()}行: {line}', end='') 

运行后,输出如下

$ python demo.py
a.txt 第1行: hello
a.txt 第2行: world
b.txt 第1行: hello
b.txt 第2行: python

这个用法和 glob 模块简直是绝配

import fileinput
import glob
for line in fileinput.input(glob.glob("*.txt")):
    if fileinput.isfirstline():
        print('-'*20, f'Reading {fileinput.filename()}...', '-'*20)
    print(str(fileinput.lineno()) + ': ' + line.upper(), end="")

运行效果如下

$ python demo.py
-------------------- Reading b.txt... --------------------
1: HELLO
2: PYTHON
-------------------- Reading a.txt... --------------------
3: HELLO
4: WORLD

4. 读取的同时备份文件

fileinput.input 有一个 backup 参数,你可以指定备份的后缀名,比如 .bak

import fileinput
with fileinput.input(files=("a.txt",), backup=".bak") as file:
    for line in file:
        print(f'{fileinput.filename()} 第{fileinput.lineno()}行: {line}', end='') 

运行的结果如下,会多出一个 a.txt.bak 文件

$ ls -l a.txt*
-rw-r--r--  1 MING  staff  12  2 27 10:43 a.txt
$ python demo.py
a.txt 第1行: hello
a.txt 第2行: world
$ ls -l a.txt*
-rw-r--r--  1 MING  staff  12  2 27 10:43 a.txt
-rw-r--r--  1 MING  staff  42  2 27 10:39 a.txt.bak

5. 标准输出重定向替换

fileinput.input 有一个 inplace 参数,表示是否将标准输出的结果写回文件,默认不取代

请看如下一段测试代码

import fileinput
with fileinput.input(files=("a.txt",), inplace=True) as file:
    print("[INFO] task is started...") 
    for line in file:
        print(f'{fileinput.filename()} 第{fileinput.lineno()}行: {line}', end='') 
    print("[INFO] task is closed...") 

运行后,会发现在 for 循环体内的 print 内容会写回到原文件中了。而在 for 循环体外的 print 则没有变化。

$ cat a.txt
hello
world
$ python demo.py
[INFO] task is started...
[INFO] task is closed...
$ cat a.txt 
a.txt 第1行: hello
a.txt 第2行: world

利用这个机制,可以很容易的实现文本替换。

import sys
import fileinput
for line in fileinput.input(files=('a.txt', ), inplace=True):
    #将Windows/DOS格式下的文本文件转为Linux的文件
    if line[-2:] == "\r\n":  
        line = line + "\n"
    sys.stdout.write(line)

附:如何实现 DOS 和 UNIX 格式互换以供程序测试,使用 vim 输入如下指令即可

DOS转UNIX::setfileformat=unix
UNIX转DOS::setfileformat=dos

6. 不得不介绍的方法

如果只是想要 fileinput 当做是替代 open 读取文件的工具,那么以上的内容足以满足你的要求。

  • fileinput.filenam()
    返回当前被读取的文件名。在第一行被读取之前,返回 None
  • fileinput.fileno()
    返回以整数表示的当前文件“文件描述符”。当未打开文件时(处在第一行和文件之间),返回 -1
  • fileinput.lineno()
    返回已被读取的累计行号。在第一行被读取之前,返回 0 。在最后一个文件的最后一行被读取之后,返回该行的行号。
  • fileinput.filelineno()
    返回当前文件中的行号。在第一行被读取之前,返回 0 。在最后一个文件的最后一行被读取之后,返回此文件中该行的行号。

但若要想基于 fileinput 来做一些更加复杂的逻辑,也许你会需要用到如下这几个方法

  • fileinput.isfirstline()
    如果刚读取的行是其所在文件的第一行则返回 True ,否则返回 False
  • fileinput.isstdin()
    如果最后读取的行来自 sys.stdin 则返回 True ,否则返回 False
  • fileinput.nextfile()
    关闭当前文件以使下次迭代将从下一个文件(如果存在)读取第一行;不是从该文件读取的行将不会被计入累计行数。直到下一个文件的第一行被读取之后文件名才会改变。在第一行被读取之前,此函数将不会生效;它不能被用来跳过第一个文件。在最后一个文件的最后一行被读取之后,此函数将不再生效。
  • fileinput.close()
    关闭序列。

7. 进阶一点的玩法

fileinput.input() 中有一个 openhook 的参数,它支持用户传入自定义的对象读取方法。

若你没有传入任何的勾子,fileinput 默认使用的是 open 函数。

fileinput 为我们内置了两种勾子供你使用

  1. fileinput.hook_compressed(*filename*, *mode*)
    使用 gzip bz2 模块透明地打开 gzip 和 bzip2 压缩的文件(通过扩展名 '.gz' '.bz2' 来识别)。如果文件扩展名不是 '.gz' '.bz2' ,文件会以正常方式打开(即使用 open() 并且不带任何解压操作)。使用示例: fi = fileinput.FileInput(openhook=fileinput.hook_compressed)
  2. fileinput.hook_encoded(*encoding*, *errors=None*)
    返回一个通过 open() 打开每个文件的钩子,使用给定的 encoding errors 来读取文件。使用示例: fi = fileinput.FileInput(openhook=fileinput.hook_encoded("utf-8", "surrogateescape"))

如果你自己的场景比较特殊,以上的三种勾子都不能满足你的要求,你也可以自定义。

这边我举个例子来抛砖引玉下

假如我想要使用 fileinput 来读取网络上的文件,可以这样定义勾子。

  1. 先使用 requests 下载文件到本地
  2. 再使用 open 去读取它
def online_open(url, mode):
    import requests
    r = requests.get(url) 
    filename = url.split("/")[-1]
    with open(filename,'w') as f1:
        f1.write(r.content.decode("utf-8"))
    f2 = open(filename,'r')
    return f2

直接将这个函数传给 openhook 即可

import fileinput
file_url = 'https://www.csdn.net/robots.txt'
with fileinput.input(files=(file_url,), openhook=online_open) as file:
    for line in file:
        print(line, end="")

运行后按预期一样将 CSDN 的 robots 的文件打印了出来

User-agent: * 
Disallow: /scripts 
Disallow: /public 
Disallow: /css/ 
Disallow: /images/ 
Disallow: /content/ 
Disallow: /ui/ 
Disallow: /js/ 
Disallow: /scripts/ 
Disallow: /article_preview.html* 
Disallow: /tag/
Disallow: /*?*
Disallow: /link/
Sitemap: https://www.csdn.net/sitemap-aggpage-index.xml
Sitemap: https://www.csdn.net/article/sitemap.txt 

8. 列举一些实用案例

案例一 :读取一个文件所有行

import fileinput
for line in fileinput.input('data.txt'):
  print(line, end="")

案例二 :读取多个文件所有行

import fileinput
import glob
for line in fileinput.input(glob.glob("*.txt")):
    if fileinput.isfirstline():
        print('-'*20, f'Reading {fileinput.filename()}...', '-'*20)
    print(str(fileinput.lineno()) + ': ' + line.upper(), end="")

案例三 :利用fileinput将CRLF文件转为LF

import sys
import fileinput
for line in fileinput.input(files=('a.txt', ), inplace=True):
    #将Windows/DOS格式下的文本文件转为Linux的文件
    if line[-2:] == "\r\n":  
        line = line + "\n"
    sys.stdout.write(line)

案例四 :配合 re 做日志分析:取所有含日期的行

#--样本文件--:error.log
1970-01-01 13:45:30  Error: **** Due to System Disk spacke not enough...
1970-01-02 10:20:30  Error: **** Due to System Out of Memory...
#---测试脚本---
import re
import fileinput
import sys
pattern = '\d{4}-\d{2}-\d{2} \d{2}:\d{2}:\d{2}'
for line in fileinput.input('error.log',backup='.bak',inplace=1):
    if re.search(pattern,line):
        sys.stdout.write("=> ")
        sys.stdout.write(line)
#---测试结果---
=> 1970-01-01 13:45:30  Error: **** Due to System Disk spacke not enough...
=> 1970-01-02 10:20:30  Error: **** Due to System Out of Memory...

案例五 :利用fileinput实现类似于grep的功能

import sys
import re
import fileinput
pattern= re.compile(sys.argv[1])
for line in fileinput.input(sys.argv[2]):
    if pattern.match(line):
        print(fileinput.filename(), fileinput.filelineno(), line)
$ ./demo.py import.*re *.py