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题目: 解密 AlphaFold2- 从蛋白从头折叠方法 RaptorX 谈起

报告人: 王晟 (深度学习结构预测程序 tFold

开发者 前腾讯 AI-Lab 高级专家)

时间: 4 1 日(星期四)上午 10 30-11 30

地点: 西区生物楼 531

摘要 去年 12 月初,相信大家的朋友圈都被 DeepMind AlphaFold2 AF2 )给刷屏了,因为 AF2 在具有“蛋白质奥林匹克竞赛”之称的第 14 届国际蛋白质结构预测大赛( CASP14 )上横扫全部参赛选手,以异常夸张的结构预测精度令世人震撼。 DeepMind 表示, AF2 基本解决了蛋白折叠问题这个困扰人类 50 年之久的问题。《自然》杂志在随后的评论更是称 AF2 “将改变一切”。那么, AF2 究竟是什么?它是如何一步步进化到如此高的精度的?有哪些底层逻辑是值得我们深入思考的?我将给出自己的见解,一切从第一代基于深度学习的蛋白从头折叠方法 RaptorX 谈起。

报告人简介 王晟博士, 2005 年毕业于上海交通大学生命科学院, 2010 年于中国科学院理论物理所取得博士学位,之后分别在 TTIC ,芝加哥大学以及 KAUST 从事 Research Scientist 工作。 2019 年回国后,在腾讯 AI Lab 担任高级研究专家。王晟博士主要从事基于人工智能的计算生物学研究,尤其是基于深度学习的蛋白质结构从头预测,达到了国际先进水准( CASP12/14 蛋白接触图预测第一名)。近五年来,王晟在 PNAS, Cell Systems, Nature Protocols, Nucleic Acids Research, Genome Biology, Bioinformatics, Brief. in Bioinform., PloS Comp. Biol. 等国际知名期刊上发表论文 60 多篇;会议论文近 30 篇,包括计算生物的知名会议 ISMB, RECOMB, ECCB 等,以及计算机视觉领域知名会议 CVPR 等。 Google Scholar 引用接近 4200 次, h-index 27

报告邀请人: 刘海燕教授