题目:
解密
AlphaFold2-
从蛋白从头折叠方法
RaptorX
谈起
报告人:
王晟
(深度学习结构预测程序
tFold
开发者
、
前腾讯
AI-Lab
高级专家)
时间:
4
月
1
日(星期四)上午
10
:
30-11
:
30
地点:
西区生物楼
531
室
摘要
:
去年
12
月初,相信大家的朋友圈都被
DeepMind
的
AlphaFold2
(
AF2
)给刷屏了,因为
AF2
在具有“蛋白质奥林匹克竞赛”之称的第
14
届国际蛋白质结构预测大赛(
CASP14
)上横扫全部参赛选手,以异常夸张的结构预测精度令世人震撼。
DeepMind
表示,
AF2
基本解决了蛋白折叠问题这个困扰人类
50
年之久的问题。《自然》杂志在随后的评论更是称
AF2
“将改变一切”。那么,
AF2
究竟是什么?它是如何一步步进化到如此高的精度的?有哪些底层逻辑是值得我们深入思考的?我将给出自己的见解,一切从第一代基于深度学习的蛋白从头折叠方法
RaptorX
谈起。
报告人简介
:
王晟博士,
2005
年毕业于上海交通大学生命科学院,
2010
年于中国科学院理论物理所取得博士学位,之后分别在
TTIC
,芝加哥大学以及
KAUST
从事
Research Scientist
工作。
2019
年回国后,在腾讯
AI Lab
担任高级研究专家。王晟博士主要从事基于人工智能的计算生物学研究,尤其是基于深度学习的蛋白质结构从头预测,达到了国际先进水准(
CASP12/14
蛋白接触图预测第一名)。近五年来,王晟在
PNAS, Cell Systems, Nature Protocols, Nucleic Acids Research, Genome Biology, Bioinformatics, Brief. in Bioinform., PloS Comp. Biol.
等国际知名期刊上发表论文
60
多篇;会议论文近
30
篇,包括计算生物的知名会议
ISMB, RECOMB, ECCB
等,以及计算机视觉领域知名会议
CVPR
等。
Google Scholar
引用接近
4200
次,
h-index
为
27
。
报告邀请人:
刘海燕教授