ImageJ
老司机带你使用ImageJ高效分析图片
ImageJ( https://imagej.nih.gov/ij/ )是免费开源的图像处理软件,在生物、医学中得到了广泛的使用。俗话说时间就是金钱,效率就是生命。对科研人员来说,提高分析图片的效率可以大大加快科研进度,早日发表SCI论文。今天半夏就给大家分享更高效的使用ImageJ分析图片的实用技巧! MBF tools辅助图片分析ImageJ官网resources下Toolsets有很多实用Macro可供下载: [图片] MBF ImageJ是加拿大McMaster University的Health Sciences Centre发布的…
ImageJ实用技巧——曲率计算与拟合(插件篇)
这篇文章是为了解决一个问题: 怎么利用ImageJ测量一条曲线各个点的曲率。首先我们需要搞清楚曲率的定义: 曲率(curvature),表明曲线在某一点的弯曲程度的数值。曲率越大,表示曲线的弯曲程度越大。曲率的倒数就是曲率半径 。 [图片] 曲率的计算公式如下: [图片] 这篇文章为大家介绍一个功能强大的插件—— Kappa:Kappa Kappa Tutorial [图片] Kappa可以方便地进行曲率的测量,以及曲线的拟合。我主要介绍这款插件的安装,以及常用功能(曲率计算和拟…
【实验技术学习笔记】Western Blot条带分析|Image J和Graphpad条带灰度分析处理过程
这是有关于Western Blot第二篇学习帖子,上一篇link如下(如何提取蛋白制作胶以及相应注意事项) [文章: 【实验技术学习笔记】Western Blot] [图片] 这里是我在实验中运用到的方法分享给大家【个人向】,如果有任何建议欢迎各位知友提出来,我们一起进步! 1. Western Blot条带问题分析每一次做WB的时候都是大量的“试剂输出”以及时间成本,所以跑出来的条带不清晰对于大家来讲都非常“伤”。因此最关键的是做完之后需要进行反思和分析。大家可…
说一个非常简单的办法吧。 直接在电脑端登录微信。 微信聊天框上面就有截图功能,这个大家都知道,就不用多说了吧。 [图片] 点击截图后,鼠标箭头指在哪里,就会显示出相应的RGB数值。 总之自己去试试就晓得了,希望对你能有帮助。 (完) 我的其它内容: [文章: 安利一些男士双肩包,它们皆来自知名品牌!] [文章: 男包种草|盘点一些知名品牌的双肩包] [文章: 男包选购|安利一些值得入手的双肩背包] [文章: 男士双肩背包推荐,让你选包不再发愁!]
如何用ImageJ进行血管分析?
血管在协调大脑内的神经元细胞网络的正常发育中发挥重要作用,血管与脑内其他细胞存在信号交流。 2018年8月24日国际著名期刊Science在线发表题为“Endothelial Dab1 signaling orchestrates neuro-glia-vessel communication in the central nervous system”的文章。文章采用了多种血管分析方法,值得我们学习。 1. 血管网络分析Fig 1F,G,Isolectin B4(IB4)染色的视网膜血管网络分析,统计指标为血管的径向长度(vessel radi…
ImageJ实用技巧——2D细胞自动追踪(插件篇)
上一篇文章介绍了 怎样利用Manual Tracking,对2D图片进行手动追踪。 [文章: ImageJ实用技巧——2D细胞手动追踪(插件篇)] 但是如果视频的时间很长,手动追踪就十分费时费力。这篇文章会介绍怎么 利用TrackMate进行自动细胞追踪:TrackMate TrackMate的功能十分强大,可以 对2D、3D物体进行自动,半自动和手动跟踪。同时TrackMate也提供了多种可视化和分析工具,有助于评估结果的相关性[1]。 [图片] 这一篇还是用ImageJ自带的范例,示范…
HRTEM是透射电镜的一种,将晶面间距通过明暗条纹形象的表示出来。通过测定明暗条纹的间距,然后与晶体的标准晶面间距d对比,确定属于哪个晶面。这样很方便的标定出晶面取向,或者材料的生长方向。Digital Micrograph是一个用于透射电镜数据采集和分析的软件,它由美国Gatan公司研发。 在电子显微学界,Gatan DigitalMicrograph (DM)是一个为人皆知的软件。DM 具有采集图像,图像处理和分析,数据管理和报告打印等多种功能。 (1…