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k-
GPU
:适用于
GPU
和其他
加速
器的
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k
OpenCL和Cuda
加速
版的
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k4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。
OpenCL
版本
是与TU-Darmstadt合作开发的,能够针对CPU,
GPU
和FPGA架构。
Cuda
版本
是与Nvidia合作开发的,以便在Oak Ridge国家实验室(ORNL)峰会上运行
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k-
GPU
,其中包括Jubilee Development公司的Aaron Scheinberg开发的批量配体管线。
使用
GPU
和基于梯度的本地搜索
加速
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k4, 2021,10.1021 / acs.jctc.0c01006
基于梯度的本地搜索方法(例如ADADELTA),以及
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k 4中Solis-Wets的改进
版本
。
1.创建一个文件夹 例如:mkdir /media/test/
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uments/Glinttsd/
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k4.2
2.cd 到文件夹中,使用git init
3.用git pull https://
github
.com/ccsb-scripps/
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k-
GPU
.git把
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k4-
GPU
的源码从
github
下载下来,由于速度比较慢,可以用下面的命令代替
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k-
GPU
:
加速
分子对接的强大工具
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k-
GPU
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k for
GPU
s and other accelerators项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/au/
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k-
GPU
项目介绍
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k-
GPU
是由 Scripps Research 的 Forli 实验室开发的一款
开源
项目,旨在通过
GPU
和其...
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k-
GPU
开源
项目实战指南
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k-
GPU
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k for
GPU
s and other accelerators项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/au/
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k-
GPU
1. 项目介绍
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k-
GPU
是由斯克里普斯研究所的Forli实验室开发的一个
开源
软件套件,专注于利用
GPU
和其他
加速
器进行计算对接和...
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k Vina是用于分子对接和虚拟筛选的
开源
程序,由Scripps研究所分子图形实验室的Oleg Trott博士设计和实现,是目前使用最为广泛的分子对接软件之一。
分子对接技术,作为计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design,CADD)的重要方法,已广泛应用于药物发现阶段的早期虚拟筛选、药物分子设计、先导化合物优化、药物潜在作用靶点发现、药物-靶点相互作用机制、为重要的药物代谢酶寻找特异性配体等。
目前,限于算力,或者高效灵活地调用大规模计算集群的能力,当前的虚拟.
CSDN-Ada助手: