Auto Doc k- GPU :适用于 GPU 和其他 加速 器的 Auto Doc k OpenCL和Cuda 加速 版的 Auto Doc k4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。 OpenCL 版本 是与TU-Darmstadt合作开发的,能够针对CPU, GPU 和FPGA架构。 Cuda 版本 是与Nvidia合作开发的,以便在Oak Ridge国家实验室(ORNL)峰会上运行 Auto Doc k- GPU ,其中包括Jubilee Development公司的Aaron Scheinberg开发的批量配体管线。 使用 GPU 和基于梯度的本地搜索 加速 Auto Doc k4, 2021,10.1021 / acs.jctc.0c01006 基于梯度的本地搜索方法(例如ADADELTA),以及 Auto Doc k 4中Solis-Wets的改进 版本 。 1.创建一个文件夹 例如:mkdir /media/test/ Doc uments/Glinttsd/ Auto Doc k4.2 2.cd 到文件夹中,使用git init 3.用git pull https:// github .com/ccsb-scripps/ Auto Doc k- GPU .git把 Auto Doc k4- GPU 的源码从 github 下载下来,由于速度比较慢,可以用下面的命令代替
Auto Doc k- GPU 加速 分子对接的强大工具 Auto Doc k- GPU Auto Doc k for GPU s and other accelerators项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/au/ Auto Doc k- GPU 项目介绍 Auto Doc k- GPU 是由 Scripps Research 的 Forli 实验室开发的一款 开源 项目,旨在通过 GPU 和其...
Auto Doc k- GPU 开源 项目实战指南 Auto Doc k- GPU Auto Doc k for GPU s and other accelerators项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/au/ Auto Doc k- GPU 1. 项目介绍 Auto Doc k- GPU 是由斯克里普斯研究所的Forli实验室开发的一个 开源 软件套件,专注于利用 GPU 和其他 加速 器进行计算对接和...
Auto Doc k Vina是用于分子对接和虚拟筛选的 开源 程序,由Scripps研究所分子图形实验室的Oleg Trott博士设计和实现,是目前使用最为广泛的分子对接软件之一。 分子对接技术,作为计算机辅助药物设计(Computer Aided Drug Design,CADD)的重要方法,已广泛应用于药物发现阶段的早期虚拟筛选、药物分子设计、先导化合物优化、药物潜在作用靶点发现、药物-靶点相互作用机制、为重要的药物代谢酶寻找特异性配体等。 目前,限于算力,或者高效灵活地调用大规模计算集群的能力,当前的虚拟.
CSDN-Ada助手: 恭喜您发布了第四篇博客!看到标题是“AutoDock-GPU版本安装-报错!”,可能是在安装过程中遇到了一些问题。希望您能够顺利解决报错的情况,并分享解决方法给更多有需要的读者。接下来,建议您可以尝试写一篇关于如何优化AutoDock-GPU版本性能的文章,或者分享一些关于分子对接的实际案例,让读者更深入了解这方面的知识。期待您更多精彩的创作! 如何快速涨粉,请看该博主的分享:https://hope-wisdom.blog.csdn.net/article/details/130544967?utm_source=csdn_ai_ada_blog_reply5