import pathos.multiprocessing as mp
class Model_Output_File():
Class to read Model Output files
def __init__(self, ftype = ''):
Constructor
# Create a sqlite database in the analysis directory
self.db_name = 'sqlite:///' + constants.anly_dir + os.sep + ftype + '_' + '.db'
self.engine = create_engine(self.db_name)
self.ftype = ftype
def parse_DGN(self, fl):
df = pandas.read_csv(...)
df.to_sql(self.db_name, self.engine, if_exists='append')
def collect_epic_output(self, fls):
pool = mp.ProcessingPool(4)
if(self.ftype == 'DGN'):
pool.map(self.parse_DGN, fls)
else:
logging.info( 'Wrong file type')
if __name__ == '__main__':
list_fls = fnmatch.filter(...)
obj = Model_Output_File(ftype = 'DGN')
obj.collect_model_output(list_fls)
在上面的代码中,我使用pathos多处理库来避免类的python多处理问题。但是我得到了一个pickling错误。
pool.map(self.parse_DGN, fls)
File "C:\Anaconda64\lib\site-packages\pathos-0.2a1.dev0-py2.7.egg\pathos\multiprocessing.py", line 131, in map
return _pool.map(star(f), zip(*args)) # chunksize
File "C:\Anaconda64\lib\multiprocessing\pool.py", line 251, in map
return self.map_async(func, iterable, chunksize).get()
File "C:\Anaconda64\lib\multiprocessing\pool.py", line 567, in get
raise self._value
cPickle.PicklingError: Can't pickle <type 'function'>: attribute lookup __builtin__.function failed
How do I fix this?
与Python pathos的腌制问题
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5
个评论
我是
pathos
的作者。 你得到了一个
cPickle.PicklingError
......而你不应该用
pathos
得到它。 你是否安装了
multiprocess
,如果安装了,你是否有一个C编译器? 你可以通过导入
dill
,并对对象进行
dill.copy
,来检查是否有腌制错误。 如果这样做了,那么你可能有一些安装问题,
pathos
找到的是
multiprocessing
的标准库版本,而不是提供更好的序列化的分叉。
你会
dill.copy(self.parse_DGN)
。 所以,如果你发现python标准库
multiprocessing
,那么你可能需要安装一个编译器......比如Microsoft Visual Studio Community。 请看。
github.com/mmckerns/tuthpc
在安装了MS编译器之后,你是否重建了
multiprocess
?
好吧,这似乎很奇怪。
multiprocess
应该只是
pip install
,没有问题。 也许你可以在
multiprocess
的github页面上把这个问题作为一个票据发布? 这样的话,我就可以更好地诊断你的追踪问题了? 在没有看到回溯/构建输出的情况下,我唯一能想到的是,你的PYTHONPATH不正常。
酷。享受吧! 如果你发现你有进一步的问题,请随时提交一个票据。
user308827
发布于
2015-09-30
2
个回答
Mike McKerns
发布于
2017-02-20
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