报告人:邓明华 北京大学 教授
报告摘要:随着单细胞人类细胞图谱
(HCA)
等大型研究计划的进行,大量的
RNA
测序数据得以汇集,这些大型单细胞图谱可以作为目标研究的参考数据。然而,由于数据集之间的批次效应
(Batch Effect)
,使得基于参考数据的学习变得困难。本报告将介绍课题组最近开发的两个算法
scSemiCluster
和
scMRA.
前者考察从单个参考数据、后者考察从多个参考数据到目标数据的标注迁移问题;算法挖掘了不同细胞类型的结构关系,在实现目标数据精确标注的同时,能够有效去除不同数据之间的批次效应。
报告人简介:邓明华,北京大学数学科学学院教授。
1987
年
9
月
-1998
年
1
月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。
2003
年
8
月晋升为副教授,
2006
年任博士生导师,
2009
年
8
月晋升为教授。其间
2001
年
2
月-
2003
年
8
月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究,
2009
年
8
月
-2010
年
1
月美国耶鲁大学访问副教授。现任中国商业统计学会副会长,中国工业与应用数学学会数学建模专业委员会副主任,中国运筹学会计算系统生物学分会理事;邓明华从事生物信息学研究,发表
SCI
论文
90
余篇。曾先后主持
6
项自然科学基金面上项目和
1
项
863
项目,参加
3
项
973
项目和
2
项科技部重点研发项目。
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