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https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py/src
Dependencies
Python 2.6, 2.7, 3.2 or above, or PyPy 2.0 or above.
A functional MPI 1.x/2.x/3.x implementation like MPICH or Open MPI built with shared/dynamic libraries.
To work with the in-development version, you need to install Cython.
默认已安装有anaconda python 2.7.11
1. openmpi
http://blog.csdn.net/swuteresa/article/details/9405383
1.1 编译器的检查
gcc --version
g++ --version
python --version
1.2.下载(可先cd /opt/目录下再wget)
URL: http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.10/
wget https://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.10/downloads/openmpi-1.10.2.tar.gz
tar xvzf openmpi-1.10.x.tar.gz
cd openmpi-xxx/
1.3.安装openMPI(默认至目录:/usr/local/lib):
./configure
1.4.安装所有需要的文件:
sudo make all install
1.5.添加库共享路径:
sudo gedit /etc/profile
在profile文件的最后加上一行:
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib
如果是ubuntu server 则 vi ~/.bashrc
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib
使该配置文件生效:
source /etc/profile
1.6.进行测试:
cd openmpi-1.10.2/examples
mpirun -np 4 hello_c
注意:如果是root账户会提示添加 --allow.xxx参数
2. mpich 和 Cython 二选一安装,都装了比较保险
http://www.mpich.org/downloads/
wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.2/mpich-3.2.tar.gz
tar xvzf mpich.xxx.tar.gz
cd mpich.xxx/
./configue
make install
3. Cython
wget https://pypi.python.org/packages/source/C/Cython/Cython-0.23.4.tar.gz#md5=157df1f69bcec6b56fd97e0f2e057f6e
tar xvzf Cython.xxx.tar.gz好像whl在ubuntu server 14下无法安装
cd Cython.xxx/
./configure
如果报错没有 fortran 77 compiler 就安装一个,如果./configure再报fortran 90 compiler不管,
apt-get install fortran77-compiler
./configure
python setup.py install
ipython下
输入import Cython,无错误提示表示成功
4.安装mpi4py
https://pypi.python.org/pypi/mpi4py/#downloads
ubuntu server 14.04用whl安装有错误提示,用tar.gz即可
wget https://pypi.python.org/packages/source/m/mpi4py/mpi4py-2.0.0.tar.gz#md5=4f7d8126d7367c239fd67615680990e3
tar xvzf mpi4py.xxx.tar.gz
cd mpi4py.xxx/
python setup.py install
ipython下
输入import mpi4py
输入from mpi4py import MPI
均无错误提示,表示安装成功。 安装mpi4py的方法直接pip install mpi4py不可取。需要安装以下依赖包:https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py/srcDependenciesPython 2.6, 2.7, 3.2 or above, or PyPy 2.0 or above.A functional MPI 1.x/2.x/3.x impleme 1 前置环境 安装 安装 openmpi 前需要 安装 一些编译器,确保你已经 安装 了如下工具:gcc,g++, py thon。可以使用下面的命令测试 gcc --version g++ --version py thon --version 如果出现了版本号则说明已经 安装 了对应的环境。 如果缺少对应的环境,在 ubuntu 环境下使用apt-get 安装 即可 sudo apt-get install g++ 如果使用 ubuntu 默认的源可能会出现下面的问题 这时候换一个源应该就能够解决,如使用科大
1. open- mpi 是什么 open- mpi 的官方定义:A High Performance Message Passing Library(from https://www.open- mpi .org/) MPI 是Message Passing Interface的简称,也就是消息传递。消息传递指的是并行执行的各个进程具有自己独立的堆栈和代码段,作为互不相关的多个程序独立执行,进程之间的信
此博文包含图片 (2018-11-04 21:37:12) http://blog.sina.com.cn/s/blog_151391cb60102z0e3.html 标签: it 杂谈 分类: Linux 一、 MPI 多机并行接口协议 MPI :Message-Passing Interface,“消息传递接口”协议 进程级;分布式存储;显式;可扩展性好;编程复杂 需要分析及划分应用程序问题,并将问题映射到分布式进程集合 需要解决通信延迟大和负载不平衡两个主要问题 集群资源不够起所有insta
目录1. 安装 MPICH 2. 安装 JAVA环境3. 下载TAU(及PDT)4. 提取并配置 安装 5. 配置Vs Code或直接使用终端编译运行 本文所使用方法在 ubuntu 16.04LTS和2020年3月19日最新的20.04LTS每日版本上进行过验证。 TAU (Tuning and Analysis Utilities) Performance System® is a portable pr...
ubuntu 16.04 安装 OpenMPI mpi 4 py 和torchsparse一、 安装 OpenMPI 1、下载各种文件2、 安装 GCC3、 安装 openmpi 二、 安装 mpi 4 py 1、下载 mpi 4 py 源文件2、 安装 mpi 4 py 三、 安装 torchsparse、torchpack1、下载各种文件2、 安装 sparsehash3、 安装 torchsparse4、 安装 torchpack参考文章 一、 安装 OpenMPI 1、下载各种文件 a. 下载 openmpi 源文件,—> 官网。选择自己想 安装 的版本,这里选择 4.0
安装 mpi 4 py 可以分为以下几个步骤: . 安装 MPI 库:4 py 依赖于 MPI 库,需要先 安装 MPI 库。常用的 MPI 库包括 OpenMPI MPICH 。可以以下命令 安装 OpenMPI : - Ubuntu `sudo apt-get install openmpi -bin lib openmpi -dev` - CentOS:`sudo yum install openmpi openmpi -devel` - macOS:`brew install open- mpi ` 2. 安装 mpi 4 py :可以通过 pip 安装 mpi 4 py : pip install mpi 4 py 如果你在 安装 时遇到了编译器相关的错误,可以尝试指定 MPI 库的路径和编译器: MPI CC=/path/to/ mpi cc pip install mpi 4 py 其中 `/path/to/ mpi cc` 是 MPI 编译器 mpi cc 所在的路径。 3. 验证 安装 安装 完成后,可以通过以下命令验证 mpi 4 py 是否 安装 成功: mpi run -n 4 py thon -c 'from mpi 4 py import MPI ; print( MPI .COMM_WORLD.Get_rank())' 这个命令会启动 4 个进程,每个进程运行一个 Py thon 解释器,并输出它们的进程编号。如果输出的结果为 0、1、2、3,则说明 mpi 4 py 安装 成功。 希望这些步骤能够帮助你成功 安装 mpi 4 py