在Ubuntu上用openmpi 3.0.0加载Rmpi时出现错误

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我在尝试安装Rmpi时遇到了一些库的问题，在Ubuntu 16.04上从源码安装openmpi 3.0.0到/usr/local。

open mpi似乎已经正确安装， mpirun 。--版本有效

当我试图用这个命令来安装Rmpi时

sudo R CMD INSTALL ./Downloads/Rmpi_0.6-6.tar.gz --configure-args="--with-Rmpi-type={OPENMPI}"
它编译得很好，并且找到了库
I am here /usr/local and it is OpenMPI
Trying to find mpi.h ...
Found in /usr/local/include
Trying to find libmpi.so or libmpich.a ...
Found libmpi in /usr/local/lib
checking for orted... yes
checking for openpty in -lutil... yes
checking for main in -lpthread... yes
configure: creating ./config.status
但当它进行负载测试时，我得到的是
** testing if installed package can be loaded
*** An error occurred in MPI_Init
*** on a NULL communicator
*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (processes in this communicator will now abort,
***    and potentially your MPI job)
我试了很多方法，但还是没有成功。  我怎样才能追踪到与mpi的连接中的错误？


           
            
             
              Gilles Gouaillardet
             
             ：


           
            
             
              你可以运行一个简单的mpi helloworld程序吗？ 在Open MPI中有一个
              
               examples/hello_c.c
              
              。


           
            
             
              Thx Gilles, I found it but don't know how to run it.  Suggestion?


           
            
             
              Gilles Gouaillardet
             
             ：


           
            
             
              
               mpicc hello_c.c; mpirun ./a.out


           
            
             
              不认为它是快乐的，得到这个 [JAM-Home-PC:43694] mca_base_component_repository_open: unable to open mca_mpool_grdma:/usr/local/lib/openmpi/mca_mpool_grdma.so: undefined symbol: mca_mpool_base_page_size (ignored) 在/usr/local/lib/openmpi中查看，似乎我有一些以前版本的open-mpi的旧文件挂在那里，以为我已经把它们全部删除了。


           
            
             
              Gilles Gouaillardet
             
             ：


           
            
             
              你的Open MPI安装看起来很糟糕，首先
              
               rm -rf /usr/local/lib/openmpi; make install
              
              ，然后再试，这可能是以前安装的一些组件。


         
          
           linux


         
          
           openmpi


         
          
           parallel.foreach


          
           
            
             
             
              Gilles Gouaillardet
             
            
            
             发布于
             
             2018-12-16


          
           
            已采纳


          
           
            
             根据评论区的各种交流，当Open MPI被Rmpi作为一个插件使用时，似乎有一个问题。
            
            
             解决办法/工作方法是，从头开始重建Open MPI，并使用
             
              --disable-dlopen
             
             参数进行配置。