4月27日,科研处联合医学信息学院在医学信息学院会议室
举办第八十一期博士
论坛
。医学信息学院专兼职教师以及部分硕士研究生参加了论坛,论坛由学院副院长叶明全主持。
黎青青博士以“基于机器学习和转录组高通量数据的疾病状态预测研究”为题作学术报告。她指出,目前传统的数据处理算法已不能满足大数据的处理要求,机器学习作为从数据中进行学习的算法,可以对不同组学来源(如基因组学、转录组学、蛋白质组学等)的数据进行综合分析。她以发表于“Journal of Translational Medicine”的论文“XGBoost-based and tumor-immune characterized gene signature for the prediction of metastatic status in breast cancer”为例,介绍了机器学习算法在疾病分类预测、生物标志物发现和通路分析中的应用,指出该研究构建了一个准确的、稳健的预测乳腺癌转移情况的基因子集,并通过使用基于该基因子集的XGBoost模型预测了乳腺癌患者的转移情况,分类预测准确性较之前的研究显著提高,同时选取的用于分类预测的信息基因数目大幅度减少,有利于进行分子机制研究和应用到临床诊断。
黎青青,理学博士,主要研究方向生物信息学、计算生物学、多组学高通量测序数据分析等,硕博连读于中国科学技术大学生物物理学专业。参与国家自然科学基金项目4项,主持安徽省教育厅高等学校科研计划自然科学重点项目1项、重大疾病非编码RNA转化研究安徽普通高校重点实验室开放课题1项,发表SCI论文9篇,其中第一作者/通讯作者5篇。
论坛现场
(梅雅欣、黎青青/文
梅雅欣/
摄 刘影、侯东晓/审)