顶层文件夹名称test，二级文件夹按照模块分类，文件夹名称就是模块名称，顶层文件夹下包含一个顶层的Makefile，二级文件夹下包含二级Makefile。二级文件夹target存放的是编译的中间文件和最后的可执行文件，二级文件夹module1、module2和module3，是三个用于测试的模块，具体的目录结构如下图所示：

源文件的代码如下：

// main.h
#ifndef __MAIN_H__
#define __MAIN_H__
#include <stdio.h>
#include "add.h"
#include "sub.h"
#endif 
// main.c
#include "main.h"
int main()
    printf("1 + 2 = %d\n", add(1, 2));
    printf("4 - 2 = %d\n", sub(4, 2));
    return 0;
// add.h
#ifndef __ADD_H__
#define __ADD_H__
int add(int a, int b);
#endif 
// add.c
#include "add.h"
int add(int a, int b)
    return a + b;
//sub.h
#ifndef __SUB_H__
#define __SUB_H__
int sub(int a, int b);
int sub2(int a, int b);
#endif 
// sub.c
#include "sub.h"
int sub(int a, int b)
    return a - b;  
// sub2.c
#include "sub.h"
int sub2(int a, int b) 
    return b - a;
顶层Makefile
#设置编译器和相关命令
CC = gcc
MKDIR = mkdir
CP = cp
RM = rm
FIND = find
#debug文件夹里的makefile文件需要最后执行，所以这里需要执行的子目录要排除debug文件夹，这里使用awk排除了debug文件夹，读取剩下的文件夹
SUBDIRS = $(shell ls -l | grep ^d | awk '{if($$9 != "target") print $$9}')
#记住当前工程的根目录路径
ROOT_DIR=$(shell pwd)
#最终bin文件的名字，可以更改为自己需要的
BIN = test
#目标文件所在的目录
OBJS_DIR = target/tmp
#bin文件所在的目录
BIN_DIR = target/bin
TARGET = $(ROOT_DIR)/$(BIN_DIR)/$(BIN)
#将以下变量导出到子shell中，本次相当于导出到子目录下的makefile中
export CC BIN OBJS_DIR BIN_DIR ROOT_DIR MKDIR CP RM FIND
#注意这里的顺序，需要先执行SUBDIRS最后才能是DEBUG
all : $(SUBDIRS) CREATE_DIR $(TARGET)
#递归执行子目录下的makefile文件，这是递归执行的关键
.PHONY: $(SUBDIRS)
$(SUBDIRS):
	make -C $@
#创建生成目标的文件夹	
CREATE_DIR :	
	@if [ ! -d $(ROOT_DIR)/$(BIN_DIR) ]; then $(MKDIR) -p $(ROOT_DIR)/$(BIN_DIR); fi
#将所有的.o文件链接成可执行文件，设置成伪目标的原因是：希望编译都重新链接	
.PHONY: $(TARGET)	
$(TARGET): 
	$(CC) -o $@ $(shell find ./target/tmp -name *.o)
#清除所有编译生成的文件	
clean:
	@$(RM) -rf $(ROOT_DIR)/target/*
	@$(FIND) ./ -name "*.d" | xargs rm -rf
二级Makefile
#以下同根目录下的makefile的相同代码的解释
#获取所有的源文件名
CUR_SOURCE = ${wildcard src/*.c}
#将所有的.o源文件名变成.o文件名
CUR_OBJS = ${patsubst %.c, %.o, $(CUR_SOURCE)}
#获取当前目录的名称
CUR_DIR_NAME = $(shell pwd |sed 's/^\(.*\)[/]//g')
#指定.o文件存放的路径
OUTPUT_DIR = $(ROOT_DIR)/$(OBJS_DIR)/$(CUR_DIR_NAME)/src
#生成所有需要生成.o文件的全路径
OUTPUT_OBJS = $(addprefix $(ROOT_DIR)/$(OBJS_DIR)/$(CUR_DIR_NAME)/,$(CUR_OBJS))
#说明头文件路径，引入了什么头文件就在此处添加对应的头文件路径(需要手动修改)
INCLUDEPATH = -I ./include\
              -I ../module2/include\
              -I ../module3/include
all :  CREATE_DIR $(OUTPUT_OBJS)
#创建存放目标的文件夹
CREATE_DIR :
	@if [ ! -d $(OUTPUT_DIR) ]; then $(MKDIR) -p $(OUTPUT_DIR); fi
#生成.o文件，并制定.o文件路径	
$(OUTPUT_DIR)/%.o : src/%.c
	$(CC) $(INCLUDEPATH) -c $< -o $@
#生成头文件依赖的目标
src/%.d : src/%.c
	@set -e; rm -f $@; \
	$(CC) -MM $(INCLUDEPATH) $< > $@.$$$$; \
	sed 's,\($*\)\.o[ :]*,$(OUTPUT_DIR)/\1.o $@ : ,g' < $@.$$$$ > $@; \
	rm -f $@.$$$$
#引入包含头文件依赖的.d文件
-include $(CUR_SOURCE:.c=.d)	
实现头文件自动依赖时，中间文件和源文件在同一级目录中，不是很好
没有预留链接库的接口