LAMMPS分子动力学程序是一款开源免费的软件，可以模拟气态、液态、固态及混合态体系，LAMMPS软件计算速度快，计算能力强，用户使用LAMMPS既可以根据程序原有功能进行in文件编写进行模拟又可以自行编码开发出自己需求的功能。

ReaxFF是新一代的 分子力场 ，除传统力场的基本性质之外，可以模拟体系中的化学反应。ReaxFF具有模拟速度快的优点，能够处理较大体系的 化学反应 过程。在材料科学中有着极大的应用前景，帮助设计和开发新材料。

通过采用支持向量机、 神经网络 等机器学习算法训练数据集来构建模型，预测材料的结构、吸附特性、电学特性、催化性能、力学特性和热力学特性等性能，大大推动了新型材料的发现和传统材料的更新，预测结果甚至能够达到与高保真模型基本相同的精度，且计算成本很低。

一、 ReaxFF反应力场理论概述

1.1 ReaxFF反应力场的发展历程

1.2 ReaxFF反应力场的理论基础

1.3 ReaxFF反应力场参数分枝与详解

1.4 ReaxFF反应力场的应用领域

二、 ReaxFF反应力场基础入门

2.1 所需输入重要文件详解包括 control,

geo, ffield等文件

2.2 结合实例，讲解输入文件命令行，输出文件

2.3 ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看

2.4 ReaxFF反应力场开发所需文件，力场验证方法（参数或反应路径扫描）

2.5 ReaxFF反应力场运行软件(standalone ReaxFF, LAMMPS)和程序获取

2.6 ReaxFF 反应力场的选取和准备

三、分子建模，可视与计算软件

3.1 建模软件gview, material studio

3.2 可视软件molden, VMD, OVITO

3.3 ReaxFF计算软件 standalone ReaxFF, LAMMPS

3.4  LAMMPS运行设置

四、ReaxFF特殊功能介绍（主要针对standalone ReaxFF程序）

4.1 改变体系温度或体积tregime.in, vregime.in, 加电场 eregime.in等

4.2 随机产生给定比例的混合物

4.3 geo文件的产生, 设定电荷, 限制键长键角和扫描等

4.4 指定时间在体系中添加和删除特定分子

4.5 产物化学组分分析与结果可视化

4.6 巨正则蒙特卡洛模拟gcmc设置

4.7 偏执势蒙特卡洛模拟fbmc设置

五、ReaxFF进阶实例操作，理解计算模拟的过程及物理意义

 实例操作：溶液中的质子转移(JPCB,JPCL文献)

1. 建立初始模型：重点注意事项(minimization->nvt->compress->npt->nvt)

2. 输入文件设置, 开启输出unfolded坐标文件

3. 模拟步骤：能量最小化，压缩，系综平衡等

4. VMD查看结果分析：msd，扩散系数，rdf，sdf, 质子追踪等

 实例操作： 碳化硅表面石墨烯的生长（ Chem. Mater文献）

1. 建模与输入文件，表面选取与准备

2. 热分解法生长石墨烯，删除表面硅

3. cvd法生长石墨烯，添加乙炔分子

4. 可视评估石墨烯质量

（模拟结果统计与可视化）

有兴趣的小伙伴可以私聊哦！

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