至于在第二章剧情方面，描述继承组织最强杀手「幽灵」称号的主角，被分派成为犯罪组织「地狱」的女干部「克劳迪亚．麦肯宁」（Claudia McCurnnen／クロウディア・マッキェネン）身边的直属部下，并过着每天不断暗杀他人的杀戮生活。就在这样的情况下，某天当主角在执行一场地狱组织的交易行动的时候，却突然遭到袭击而导致交易失败，这场意外不但造成多名一般平民女性丧生，而且就连原本准备好用来交易的大额现金也就此下落不明。对牺牲者女性展开调查的主角，与牺牲者所留下的唯一家人的一名少女「卡尔．迪本斯」（Cal Devens／キャル・ディヴェンス）因此而相遇，不过这却是另一场新的残酷命运的开始…。

而在第三章剧情方面，描述厌倦身为犯罪组织「地狱」所养的走狗生活而决定逃亡的主角，以伪造的身分重新回到故乡日本，并在地方的教会学校潜伏生活着。但是这样的平静生活并不长久，主角的下落最后还是被地狱所发现，甚至就连班上的同学们也因此而受到牵连。身为原组织最强杀手「幽灵」，如今却是背叛者的主角，面对组织不断派遣而来的杀手刺客，主角最后的命运到底会…？