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学习《高性能计算:现代系统与应用实践》(Thomas Sterling,Matthew Anderson,Maciej Brodowicz)第 7 章 OpenMP 的基础
OpenMP
i
)
export OMP_NUM_THREADS=8 # 开几个线程,默认自动看 CPU
export OMP_DYNAMIC=TRUE # 动态线程数量
export OMP_NESTED=TRUE # 允许嵌套并行
export OMP_SCHEDULE=schedule.chunk # 循环的负载分布
使用 OpenMP
不用安装:
GCC 内置了 OpenMP 支持!
编译的时候带上 -fopenmp
就行。
#include <omp.h>
基本函数:
omp_get_num_threads() // 有多少个并行的进程: OMP_NUM_THREADS
omp_get_thread_num() // 我(当前进程)的 id
// master: 0; worker: [1, OMP_NUM_THREADS)
OpenMP 指令(制导语句):
#pragma omp <directive> <clauses> <statement>
Hello World
// hello.c
#include <omp.h>
#include <stdio.h>
int main() {
#pragma omp parallel
{ // fork
int num_threads = omp_get_num_threads();
int thread_id = omp_get_thread_num();
printf("Hello world from %d (total %d)\n", thread_id, num_threads);
} // join
return 0;
魔法是 #pragma omp parallel
:串行 -> 并行。派生出 OMP_NUM_THREADS
个进程来并行跑其后的一个代码块。
编译运行:
$ gcc-11 -fopenmp hello.c
$ ./a.out
Hello world from 1 (total 4)
Hello world from 0 (total 4)
Hello world from 3 (total 4)
Hello world from 2 (total 4)
顺序是那种乱七八糟的:并行。觉得不明显可以指定线程数量,再运行:
$ OMP_NUM_THREADS=100 ./a.out
Hello world from 2 (total 100)
Hello world from 11 (total 100)
Hello world from 35 (total 100)
Hello world from 0 (total 100)
Hello world from 98 (total 100)
上面那个程序的另一种版本:
预先定义两个变量,但是指定为各线程私有
只让 id 为 0 的进程,即主线程获取 num_threads
(其实我试了,编译成汇编和上面那个区别不大,两个变量结束并行之后都不是有效值。所以目前还不清楚这样在外面先定义好变量有啥优势 这个问题大致有答案了,见后文:[[#Why private]]。我还是喜欢局部变量就局部去定义。) ^b5e08c
// hello-v2.c
#include <omp.h>
#include <stdio.h>
int main() {
int num_threads, thread_id;
#pragma omp parallel private(num_threads, thread_id)
thread_id = omp_get_thread_num();
printf("Hello world from thread %d.\n", thread_id);
if (thread_id == 0) {
num_threads = omp_get_num_threads();
printf("Total number of thread is: %d\n", num_threads);
// printf("End of parallel: %d, %d\n", thread_id, num_threads);
// End of parallel: 1, 61694048
return 0;
编译运行:
$ gcc-11 -fopenmp hello-v2.c; ./a.out
Hello world from thread 0.
Total number of thread is: 4
Hello world from thread 3.
Hello world from thread 2.
Hello world from thread 1.
小结:OpenMP 并行:
#include <omp.h>
int main() {
#pragma omp parallel
并行的代码;
默认各线程共享上下文中的变量:在 omp parallel
后面加 private(...)
指定要各线程私有的变量。
OpenMP 并行
并行 for
线程间循环分布:通过 OpenMP,让多个线程同时(并行)处理一个 for
循环。
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
int main() {
const int N = 20;
int num_threads, thread_id;
double a[N], b[N], result[N];
for (int i = 0; i < N; i++) {
a[i] = 1.0 * i;
b[i] = 100.0 * i;
for (int i = 0; i < N; i++) {
result[i] = a[i] + b[i];
printf("TEST result[19]=%g\n", result[19]);
// TEST result[19]=1919
return 0;
要并行化处理合并两个数组的操作,只需加 5 行:
#include <omp.h> // +1
int main() {
#pragma omp parallel // +2
{ // +3
#pragma omp for // +4
for (int i = 0; i < N; i++) {
printf("%d: i=%d\n", omp_get_thread_num(), i);
result[i] = a[i] + b[i];
} // +5
printf("TEST result[19]=%g\n", result[19]);
return 0;
此处的魔法是 #pragma omp for
,把 for 分配给各个线程。中间额外加了一个 printf,可以看到 20 次循环,被几个线程平分:
0: i=0 ... 0: i=4
2: i=10 ... 2: i=14
3: i=15 ... 3: i=19
1: i=5 ... 1: i=9
TEST result[19]=1919
如果露掉这一行 #pragma omp for
,OpenMP 便无从得知你要并行这个 for。那就比较“精彩”了,4 个线程,把循环各跑一遍,极致反向优化:
0: i=0 ... 0: i=19
1: i=0 ... 1: i=19
2: i=0 ... 2: i=19
3: i=0 ... 3: i=19
TEST result[19]=1919
这个操作太常用了,所以有简化的写法:
#pragma omp parallel for
for (int i = 0; i < N; i++) {
printf("%d: i=%d\n", omp_get_thread_num(), i);
result[i] = a[i] + b[i];
小结:并行 for:
#pragma omp parallel
#pragma omp for
for (;;) {}
⬇️ 复合魔法
#pragma omp parallel for
for (;;) {}
可选:omp for
后面加子句 schedule(static.chunk)
,指定切分循环的方式。
并行 sections
有多块代码要并发执行:
一个块称为一个 section
多个 section 在一个 sections 中并行
一个线程处理一个 section
#pragma omp parallel
#pragma omp sections
{ /* section 0 */ }
#pragma omp section
{ /* section 1 */ }
#pragma omp section
{ /* section 2 */ }
类似于 parallel for
,如果开并行只是为了执行 sections,也可以用合并的 parallel sections
:
#pragma omp parallel sections
{ /* section 0 */ }
#pragma omp section
{ /* section 1 */ }
一个例子:并行地对一列数据进行统计,求最值、均值、方差:
#include <omp.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
int main() {
const int N = (1<<29); // N doubles: 4 GiB
// const int N = 10;
double *x = calloc(N, sizeof(double));
// #pragma omp parallel for // 初始化
for (int i = 0; i < N; i++) {
x[i] = i;
// 总和、均值、平方的总和
double sum = 0.0, avg = 0.0, sum2 = 0.0;
#pragma omp parallel sections shared(x, sum, avg, sum2)
// section 0: 计算 最大最小值
double max = (1<<31), min = (1<<31) - 1;
for (int i = 0; i < N; i++) {
if (x[i] < min) min = x[i];
if (x[i] > max) max = x[i];
printf("min: %f\nmax: %f\n", min, max);
#pragma omp section // section 1: 计算总和、均值
for (int i = 0; i < N; i++) {
sum += x[i];
printf("sum: %f\n", sum);
avg = sum / N;
printf("avg: %f\n", avg);
#pragma omp section // section 2: 计算平方的均值
for (int i = 0; i < N; i++) {
sum2 += x[i] * x[i];
printf("sum2: %f\n", sum2);
// 方差 = 平方的均值 - 均值的平方
double var = sum2 / N - avg * avg;
printf("var: %f\n", var);
return 0;
注意这里使用了全局共享的 sum
等几个量,是为了在并行结束后,留下这些值,用于计算方差。
编译运行,对比去掉 parallel 的版本,似乎有一定的提升:
$ openmp gcc-11 -fopenmp sections.c; time ./a.out
min: 0.000000
max: 536870911.000000
sum2: 51580834826121141939077120.000000
sum: 144115187606093856.000000
avg: 268435455.125000
var: 24019198213991840.000000
./a.out 7.34s user 4.00s system 101% cpu 11.200 total
$ openmp gcc-11 -fopenmp no-sections.c; time ./a.out
min: 0.000000
max: 536870911.000000
sum: 144115187606093856.000000
avg: 268435455.125000
sum2: 51580834826121141939077120.000000
var: 24019198213991840.000000
./a.out 8.41s user 9.52s system 72% cpu 24.587 total
OpenMP 同步
共享内存:
OpenMP 的多个并发线程之间共享全局数据
无需 send/recv 的消息传递在并发进程之间交换数值
同步机制:
协调并行程序中多个并行线程的执行
控制顺序:避免竞争 -> 冲突
隐式:join 栅栏
显示:critical、master、barrier、single
critical 指令
临界同步指令 critical
:多个并行线程互斥访问共享变量。
#paragma omp critical
{ ... }
e.g. 尝试做个并行计数器:
#include <omp.h>
#include <stdio.h>
int main() {
int n = 0;
#pragma omp parallel for shared(n)
for (int i=0; i < 40000; i++) {
#pragma omp critical
n = n + 1;
printf("n: %d\n", n);
return 0;
编译运行(运行了很多次都是对的):
$ openmp gcc-11 -fopenmp critical.c; time OMP_NUM_THREADS=1000 ./a.out
n: 40000
OMP_NUM_THREADS=1000 ./a.out 0.01s user 0.05s system 16% cpu 0.390 total
如果删掉 #pragma omp critical
,就会出现喜闻乐见的错误结果(多运行一些次就能看到各种不同的错误结果):
$ openmp gcc-11 -fopenmp no-critical.c; time OMP_NUM_THREADS=1000 ./a.out
n: 39960
OMP_NUM_THREADS=1000 ./a.out 0.01s user 0.06s system 63% cpu 0.104 total
master 指令
master
指令:只有主线程执行这一块代码,其他线程遇到则跳过。
主线程:执行这一块代码
其他线程:直接往下走,不等
#pragma omp master
{ ... }
barrier 指令
barrier
指令:同步所有并发线程:
遇到 barrier 的线程就停下来,等;
等所有进程都到了 barrier 才能继续。
#pragma omp barrier
single 指令
single
指令:宽松版 master
+ 隐式 barrier
:
在代码块({ ... }
)后面放一个隐式 barrier;
允许任意线程 Foo 执行代码块;
其他线程跳过代码块执行,但是阻塞在 barrier,等 Foo 酱执行完代码块再放行。
#pragma omp single
{ ... }
reduction 指令
规约:将大量值组合在一起,生成单个结果值。
Reduction:the action or fact of making a specified thing smaller or less in amount, degree, or size
—— New Oxford American Dictionary
这里所谓规约就是让值的个数变少的操作。(回想一下 Lisp 就很形象了。)
OpenMP 可以用 reduction
指令做规约:
double result;
#pragma omp reduction(op : result)
result = ...; // 局部 result
// 全局 result: result = reduce(op, results)
op
为某种运算:+
,-
,*
,/
,&
,|
,^
中的一个;
更复杂的规约也容易使用其他同步的方式实现。
result
为结果变量,注意这个值在块内是各线程私有,出来之后变成全局的、规约得到的结果。
#include <stdio.h>
#include <omp.h>
int main() {
const int N = 16;
float a[N], b[N], result;
for (int i = 0; i < N; i++) {
a[i] = i * 1.0;
b[i] = i * 2.0;
#pragma omp parallel for reduction(+ : result)
for (int i = 0; i < N; i++) {
result += a[i] * b[i];
printf("Result = %f\n", result);
return 0;
编译运行:
$ gcc-11 -fopenmp reduction.c; ./a.out
Result = 2480.000000
Why pragma
#pragma
是什么鬼啊?pragma
来源于 pragmatic(务实的),,所以关联的点是什么。。
Pragma,也叫做 directive。Directive 就是“指示”的意思,不知到是如何惨遭毒手,被翻译为“制导语句”的。。不翻译成“42 号混凝土”我是不敢苟同的。
总之这东西就是用来指导编译器如何编译的。(教编译器做事)
(对了,我最讨厌这种要左手连打几个字母的词了,顺便吐槽一下“Database”,这个词简直了,尤其是要大写时。其实换一种角度来考虑,还是键盘键位设计的锅。)
Why private
private
子句有何用?[[#^b5e08c|前文]]提到,在各线程内定义局部变量可以完全避免 private
,但这是站在一开始就编写 OpenMP 并行代码的角度来设计得到的结果。
OpenMP 设计的一项初衷是在尽可能少改动原有串行代码的基础上,加入并行支持。理想的情况只需加入尽可能少的制导语句(#pragma omp parallel
、#pragma omp parallel for
等)就可以让原本串行的代码变并行。
所以就有这种场景:原本的代码如下:
int i, j;
for(i = 0; i < n; i++) {
for(j = 0; j < n; j++) {
//do something
要使其支持并发,有 private
的支持,只需加一行制导语句,完全不需要改动原有任何一行代码:
int i, j;
#pragma omp parallel for private(j)
for(i = 0; i < n; i++) {
for(j = 0; j < n; j++) {
//do something
但如果没有 private
,就需要改动原有代码结构,把 j
的定义移动到第一层循环内:
int i;
#pragma omp parallel for
for(i = 0; i < n; i++) {
int j;
for(j = 0; j < n; j++) {
//do something
如果需要为 C89
(所有变量定义要写到 scope 顶部)写的代码加入并行性,这个 private
对于还是比较有意义的。
所以更多是一种兼容性吧。
最近学这些计算(有没有一种可能计算机本来就是用来做计算的😭),还真有好多代码是八几年、九几年写的,有些甚至写的是 K&R C,一直沿用至今,正确、高效、优雅、美观,真的 nb(褒义,由衷赞叹,写的确实漂亮,以带着最深沉偏见的、最批判的锋利目光去看,也无可挑剔)。
再看看现在好多所谓学“*”的 * 写的代码,我没有针对 * 语言,我是说 * 写的任何程序,真的 nb(贬义。那些“代码”,笑死,看别人接手是喜剧,要自己接手是悲剧;眼睁睁看着别人写出这种代码是人间炼狱)。
StackOverflow: OpenMP: are local variables automatically private?
StackOverflow: Is there any difference between variables in a private clause and variables defined within a parallel region in OpenMP?
StackOverflow: Variable declaration placement in C
CDFMLR