标签:
tps
ace
应该
reference
big
err
无法
注意
hive
这几天训练模型运行代码的时候,老是提示我说:Error: cannot allocate vector of size 88.1 Mb,只知道分配空间不足。
下面是查资料看到的一些回答:
一、这个是R的特点,有几个解决方法:
1.升级到R3.3.0及以上版本,对内存的管理和矩阵计算好太多。在R3.2.5上能死机的计算,在R3.3.0以上就能运行很好。
2.加载一些R语言磁盘缓存包,搜一搜吧
3.写代码的时候适当加一些清理内存的命令。
4.应该跑多线程了吧。
5.加内存作用有限。在R3.2.5上能把服务器跑死机,服务器是44核,512G内存。优化一下代码很有必要。
二、有的时候加内存条也不能解决大数据量多的需求,采用parallel计算策略吧,如果数据一次性读入也不行,可配合filematrix包,分次从硬盘读数据,不过这会慢很多。
三、R里面找到那个参数,有个地方是改最大分配内存的,在Preference之类的地方。
四、下载一个Package叫bigmemory。里面重新为大的数据集构建了类,在处理大数据集的功能上(包括几十GB)基本上是最前沿的。
链接为cran.r-project.org/web/packages/bigmemory/
五、bigmemory包是可以的。另外还提供了另外两种选择,mapReduce和RHIPE(使用Hadoop),也可以处理大数据集。
六、大神指导(http://bbs.pinggu.org/thread-3682816-1-1.html),cannot allocate vector就是典型的数据太大读不了
方法有三
一、升级硬件
二、改进算法
三、修改操作系统分配给R的内存上限, memory.size(T)查看已分配内存
memory.size(F)查看已使用内存
memory.limit()查看内存上限
object.size()看每个变量占多大内存。
memory.size()查看现在的work space的内存使用
memory.limit()查看系统规定的内存使用上限。
如果现在的内存上限不够用,可以通过memory.limit(newLimit)更改到一个新的上限。注意,在32位的R中,封顶上限为4G,无法在一个程序上使用超过4G (数位上限)。这种时候,可以考虑使用64位的版本。
详细可参考此篇,非常棒https://blog.csdn.net/sinat_26917383/article/details/51114265
1
http://jliblog.com/archives/276
2
http://cos.name/wp-content/uploads/2011/05/01-Li-Jian-HPC.pdf
3 R 高性能计算和并行计算
http://cran.r-project.org/web/views/HighPerformanceComputing.html
如果遇到这个问题,大家可以对应试试解决方案,方法还不错哦~
Error: cannot allocate vector of size 88.1 Mb问题
标签:
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应该
reference
big
err
无法
注意
hive
原文地址:https://www.cnblogs.com/babyfei/p/9565143.html
本文实例讲述了ThinkPHP提示错误Fatal
error
: Allowed memory
size
的解决方法。分享给大家供大家参考。具体分析如下:
如果你的ThinkPHP提示你:致命错误(Fatal
error
: Allowed memory
size
),根据网上说的提高服务器可使用内存,我觉得都不是好的解决办法。麻烦也没必要。因为这是ThinkPHP本身存在BUG。
错误提示:Fatal
error
: Allowed memory
size
of 1073741824 bytes exhausted (tried to
allocate
523800 bytes) in /var/w
写R程序的人,相信都会遇到过“cannot
allocate
vector
of
size
”或者“无法分配大小为…的矢量”这样的错误。原因很简单,基本都是产生一个大矩阵等对象时发生的,最干脆的解决办法有两种,第一种是加大内存换64位系统,第二种是改变算法避免如此大的对象。第一种办法,是最好的办法,不过大对象的需求是没有止尽的,终究不是长久之道。第二种办法是最好的思路,无论多么大的对象都是可以弄小的...
最近要处理蛮大的数据。结果这个数据放到R中,却出现了内存不够的
问题
。
关于计算机的基础的知识,是我一直以来的薄弱项。
我现在拥有足够的精力和时间,所以,我希望能够认真解决这个
问题
。
解决方法,并没有想象的那么复杂。
在要处理的大数据的代码前,添加gc()
即如下所示:
coverage_cutoff <- 3
coverage_percentage <- 0.2
cell_percentage <- 0.2
artefact_percentage <- 0.03
gc() #.
大神指导(http://bbs.pinggu.org/thread-3682816-1-1.html)
cannot
allocate
vector
就是典型的数据太大读不了
一、升级硬件
二、改进算法
三、修改操作系统分配给R的内存上限, memory.
使用R语言时,经常会出现cannot
allocate
vector
of
size
***这样的错误,例如,我今天就出现了下面这个错误。
Error
: cannot
allocate
vector
of
size
1.9 Gb
R语言在处理小数据是很爽,但当碰到一个模型产生了一个很大的
Vector
就很麻烦了,这时就有可能内存不够。因此需要进行内存管理。
查看当前设置下最大内存
查看当前设置...
object.
size
()看每个变量占多大内存。
memory.
size
()查看现在的work space的内存使用
memory.limit()查看系统规定的内存使用上限。如果现在的内存上限不够用,可以通过memory.limit(newLimit)更改到一个新的上限...
GIANTteacher 是地球上最大的在线培训服务。 他们拥有高度优化的培训交付系统,可以同时处理 10,000,000 次培训课程。 培训课程都以个人的唯一数字为键。 Nu
mb
erPool 的工作是充当一种负载平衡器,在学生出现学习时尽快从该池中分配数字。 绝对不能同时给两个学生编号。 否则,培训过程将受到影响,学生将体验不到完美的学习。 当学生完成他们的培训后,他们可以将他们的唯一号码放回池中供未来的学生使用。
安装和测试
git clone https://github.com/seank-com/Nu
mb
erPool.git Nu
mb
erPool
cd Nu
mb
erPool
git pull
node Nu
mb
erPool.tests.js
(可选)此存储库。 如果你知道如何使用 wget,你就不需要我的帮助来安装。 (正在考虑 npm install,请参阅下面的未来
内存分配【参考】http://www.biostatistic.net/thread-3302-1-1.html【OS】1. 当前设置下操作系统能分配给R的最大内存 memory.
size
(NA) or memory.limit()2. 查看当前R已使用的内存 memory.
size
(F) 查看已分配的内存 memory.
size
(T)3. 扩大分配的内存 ...