【R语言】R语言中的循环

【R语言】R语言中的循环

编程中减少代码重复的两个工具,一是循环,一是函数。

循环,用来处理对多个同类输入做相同事情(即迭代),如对不同列做相同操作、对不同数据集做相同操作。

R语言有三种方式实现循环:

(1)for循环、while循环

(2)apply函数族

(3)泛型函数map

一. for循环、while循环

首先作两点说明:

(1)关于“for循环运行速度慢”的说法,实际上已经过时了,现在的R、Matlab等软件经过多年的内部优化已经不慢了,之所以表现出来慢,是因为你没有注意两个关键点:

  • 提前为保存循环结果分配存储空间;
  • 为循环体中涉及到的数据选择合适的数据结构。

(2)apply函数族和泛型函数map能够更加高效简洁地实现一般的for循环、while循环,但这不代表for循环、while循环就没用了,它们可以在更高的层次使用(相对于在逐元素级别使用)

1. 基本for循环

例如,有如下的tibble数据:

library(tidyverse)
df <- tibble(
  a = rnorm(10),
  b = rnorm(10),
  c = rnorm(10),
  d = rnorm(10)
)

用复制-粘贴法,计算每一列的中位数:

median(df$a)
median(df$b)
median(df$c)
median(df$d) 

为了避免“粘贴-复制多于两次”,改用for循环实现:

output <- vector("double", ncol(df))     #1.输出
for (i in seq_along(df)) {               #2.迭代器
  output[[i]] <- median(df[[i]])         #3.循环体
output  #输出结果略

for循环有三个组件:

(1) 输出:output <- vector("double", length(x))

在循环开始之前,最好为输出分配足够的存储空间,这样效率更高:若每循环一次,就用c()合并一次,效率会很低下。

通常是用vector()函数创建一个给定长度的空向量,它有两个参数:向量类型(logical, integer, double, character等)、向量长度。

(2)迭代器:i in seq_along(df)

确定怎么循环:每次for循环将对i赋一个seq_along(df)中的值,可将i理解为代词it. 其中seq_along()是“1:length(df)”的安全版本,它能保证遇到长度为0的向量时,仍能正确工作:

y <- vector("double", 0)
seq_along(y) 
1:length(y)

你可能不会故意创建长度为0的向量,但容易不小心创建,则会导致报错。

(3) 循环体:output[[i]] <- median(df[[i]])

即执行具体操作的代码,它将重复执行,每次对不同的i值。

第1次迭代将执行:output[[1]] <- median(df[[1]]),

第2次迭代将执行:output[[2]] <- median(df[[2]]),

……

2. for循环变种

基本的for循环有4个变种:

(1) 修改已存在的对象,创建的新对象

有时需要用for循环修改一个已存在的对象,例如,对数据框 df 的每一列做归一化:

rescale01 <- function(x) {
  rng <- range(x, na.rm = TRUE)
  (x - rng[1]) / (rng[2] - rng[1])
df$a <- rescale01(df$a)
df$b <- rescale01(df$b)
df$c <- rescale01(df$c)
df$d <- rescale01(df$d)

用for循环来做,先考虑其3个组件:

输出 :已经存在,与输入相同。

迭代器 :可以将数据框看作是多个列构成的列表,故可以用seq_along(df)来迭代每一列。

循环体 :应用函数rescale01().

于是写出如下的for循环:

for (i in seq_along(df)) {
    df[[i]] <- rescale01(df[[i]])
}

通常来说,你可以用这种循环来修改一个列表或数据框,注意这里是用[[ ]], 而不是[ ]. 因为原子向量最好用[[ ]], 这样能清楚地表明你处理的是一个单独的元(而不是子集)。

(2) 循环模式

· 根据数值索引:for(i in seq_along(xs), 用x[[i]] 提取值。

· 根据元素值:for(x in xs). 若你只关心附带作用,这特别有用。例如绘图、保存文件等,因为很难高效率地保存这种结果。

· 根据名字:for(nm in names(xs)). 对每个名字,访问其对应的值 x[[nm]], 若你需要使用图形标题或文件的名称,这就很有用。当创建命名的输出时,确保按如下方式命名结果向量:

results <- vector("list", length(x))
names(results) <- names(x)

注:用数值索引迭代是最常用的形式,因为只要给定位置,名字和元素值都可以提取:

for (i in seq_along(x)) {
    name <- names(x)[[i]]
    value <- x[[i]]
}

(3) 结果长度未知

有时候,你可能不知道输出结果有多长。例如,你想要模拟一些长度随机的随机向量。你可能优先想到通过逐步增加长度的方法解决该问题:

means <- c(0, 1, 2)
output <- double()
for (i in seq_along(means)) {
  n <- sample(100, 1)
  output <- c(output, rnorm(n, means[[i]]))
str(output)

但这种做法很低效,因为每次迭代,R都要复制上一次迭代的全部数据,其复杂度为 O(n^2) .

一个好的方法是,先将结果保存为列表,等循环结束再将列表重组为一个单独的向量:

out <- vector("list", length(means))
for (i in seq_along(means)) {
  n <- sample(100, 1)
  out[[i]] <- rnorm(n, means[[i]])
str(out)
str(unlist(out))

这里是用unlist()函数将一个向量的列表摊平为一个单独的向量。更严格的方法是用purrr包中的flatten_dbl(), 若输入不是double型的列表,将会报错。

还有两种结果长度未知的情形:

· 生成一个长字符串。不是用paste()函数将上一次的迭代结果拼接到一起,而是将结果保存为字符向量,再用函数paste(output, collapse= " ")合并为一个单独的字符串;

· 生成一个大的数据框。不是依次用rbind()函数合并每次迭代的结果,而是将结果保存为列表,再用dplyr包中的bind_rows(output)函数合并成一个单独的数据框。

所以,遇到上述模式时,要先转化为更复杂的结果对象,最后再做一步合并。

(4) 迭代次数未知(while循环)

有时候你甚至不知道输入序列有多长,这通常出现在做模拟的时候。例如,你可能想要在一行中循环直到 连续 出现3个“Head”,此时不适合用for循环,而是适合用while循环。

while循环更简单些,因为它只包含两个组件:条件、循环体:

while (condition) {
  #body
}

While循环是比for循环更一般的循环,因为for循环总可以改写为while循环,但while循环不一定能改写为for循环:

for (i in seq_along(x)) {
  #循环体
#等价于
i <- 1
while (i <= length(x)) {
  #循环体
  i <- i + 1
}

下面用while循环实现:抛一枚硬币直到 连续 出现3次“正面”,需要的次数:

flip <- function() sample(c("Tail", "Head"), 1)
flips <- 0
nheads <- 0
while (nheads < 3) {
  if (flip() == "Head") {
    nheads <- nheads + 1
  } else {
    nheads <- 0
  flips <- flips + 1
flips

while循环并不常用,但在模拟时常用,特别是在预先不知道迭代次数的情形。

二. apply函数族

apply函数族可以代替大部分的for循环、while循环,其大意是“应用(apply)”某函数(fun)到一系列的对象上。根据应用到的对象的不同,是一族apply函数。

常用的有:

  • 分组计算:apply()和tapply()
  • 循环迭代:lapply()和sapply()
  • 多变量计算:mapply()
  1. 函数apply()

apply()函数是最常用的代替for循环的函数。apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维),按行或列进行循环计算,对子元素进行迭代,并把子元素以参数传递的形式给自定义的FUN函数中,并以返回计算结果。基本格式为:

apply(x, MARGIN=..., fun, ...)

其中,x为数据对象(矩阵、多维数组、数据框);

MARGIN=1表示按行,2表示按列;

fun表示要作用的函数。

x<-matrix(1:6, ncol=3)
x
apply(x,1,mean) #按行求均值
apply(x,2,mean) #按列求均值

2. 函数tapply()

按一组因子INDEX对数据列 x 分组,再分别对每组作用上函数fun。基本格式为:

tapply(x, INDEX, fun, ..., simplify=TRUE)

其中,x通常为向量;

INDEX为与x长度相同的因子列表(若不是因子,R会强制转化为因子);

simplify=TRUE且fun计算结果为标量值,则返回值为数组,若为FALSE,则返回值为list对象

dat <- data.frame(height=c(174,165,180,171,160), sex=c("F","F","M","M","F"))
tapply(dat$height,dat$sex, mean)   #计算分组均值: 不同sex对应的height的均值

3. 函数lapply()

该函数是一个最基础循环操作函数,用来对vector、list、data.frame逐元、逐成分、逐列分别应用函数fun,并返回和 x 长度同样的 list 作为结果。

基本格式为:

lapply(x, fun, ...)

其中,x为数据对象(列表、数据框、向量)。

x<-list(a=1:5, b=exp(0:3))
x
lapply(x, mean)

4. 函数sapply()

sapply() 是 lapply() 的简化版本,多了一个参数simplify,若simplify=FALSE,则同lapply(),若为TRUE,则将输出的list简化为向量或矩阵。基本格式为:

sapply(x, fun, ..., simplify=TRUE, USE.NAMES=...)

5. 函数mapply()

是函数sapply()的多变量版本,将对多个变量的每个参数作用某函数。基本格式为:

mapply(fun, ..., MoreArgs=NULL, SIMPLIFY=TRUE, USE.NAMES=TRUE)

其中,

MoreArgs为fun函数的其它参数列表;

SIMPLIFY为逻辑值或字符串,取值为TRUR时,将结果转化为一个向量、矩阵或高维阵列(但不是所有结果都可转化);

... 可以接收多个数据,mapply将fun应用于这些数据的第一个元素组成的数组,然后是第二个元素组成的数组,以此类推。

返回值是vector或matrix,取决于fun返回值是一个还是多个。

#重复生成列表list(x=1:2), 重复次数times=1:3,结果为列表
mapply(rep, times=1:3, MoreArgs = list(x=1:2))
mapply(function(x,y) x^y, c(1:3), c(1:3))
mapply(function(x,y) c(x+y, x^y), c(1:3), c(1:3))  
Alco <- data.frame(AlcoholDrunk=c("YES","YES","NO","YES","YES","YES",NA,"YES","YES","YES","YES","YES","YES","NO","NO","NO","NO","YES"), 
AmountDrunk=c(3.0, 1.0, NA ,3.0,  NA, 0.0,  NA, 0.0, NA, 1.7,  NA,  NA, 0.0,  NA,  NA,  NA,  NA, 2.0))

其中,变量AlcoholDrunk有三种取值,“YES”表示有饮酒史;“NO”表示无饮酒史;NA表示数据不可获取。

定义alcohol()函数实现功能:若AlcoholDrunk是NA,直接返回NA;若是NO,返回NO;否则返回变量AmountDrunk的值。因为需要传递两个变量的值,就需要用mapply()函数:

alcohol <- function(texVal, numVal){
  if(is.na(texVal)) {return("NA")}
      else if(texVal=="NO") {return("NO")}
  else if(is.na(numVal)) {return("amount Unknown")}
  else {return(numVal)}
mapply(alcohol, Alco$AlcoholDrunk, Alco$AmountDrunk)


三. 泛型函数map

泛型函数,相当于数学中的“泛函”,即函数的函数。

“传递一个函数给另一个函数”是非常强大的思想,这也是R作为泛函型编程语言的表现之一。

注:apply函数族也属于泛型函数。

purrr包,提供的函数足以代替许多通常的for循环。虽然apply函数族也能解决类似的问题,但purrr包更具有一致性,从而也更容易学习。另外,purrr包还支持一些快捷用法,且所有函数都是用C语言写的,速度更快。

用purrr包的解决问题的逻辑是:

(1)针对列表每个单独的元,你怎么解决某问题?一旦你解决了该问题,purrr包就可以将你的求解推广到列表中的每一个元。

(2)若你正在解决一个复杂问题,你怎么把它分解成若干小问题,使得你能够逐步完成求解?用purrr包,你就可以将这些小问题的求解步骤用管道组合到一起。


  1. map函数族

“遍历一个向量,对每个元做相同的操作,并保存结果”,这种循环模式是如此常见,所以purrr包提供了一族map函数来做这件事。一个函数针对一种类型的输出:

  • map()—映射列表,基本等同于lapply()
  • map_lgl()—映射逻辑向量
  • map_int()—映射整数型向量
  • map_dbl()—映射浮点数向量
  • map_chr()—映射字符型向量

每个函数都接受一个输入向量,应用一个函数到每一个元,再返回与输入向量同名同长度的新向量;向量的类型由map函数的后缀所确定。

注:map_*()函数必须接受原子向量,可以是行、列向量。

例如,对前文的 数据框 df,

map_dbl(df, mean)        
map_dbl(df, median)        
map_dbl(df, sd)

与用for循环相比,map函数是聚焦在所执行的操作(mean(), median(), sd()),而不是循环遍历每个元并存储结果。若改用管道操作更明显:

df %>% map_dbl(mean)